水文地質數據建設的質量有效控制是建設高質量數據庫的關鍵，除逐步提高數據庫建設人員技術水平的同時，重點考慮數據庫建設控制措施和制度的完善。
  1．建立工作日志制度建立完整的工作日志表，每個作業人員每天必須按要求填寫工作日志，將每天的工作內容全面、完整地記錄下來，并由作業組長簽名認可。
  2．建立自互檢制建立完整的自互檢表，每個作業人員做一幅圖都要進行l00%的自檢，并將自檢結果和修改處理結果如實、完整地記錄下來，由作業組長簽名認可。在自檢的基礎上，有項目負責人安排其他作業人員進行60%以上的互檢，并將互檢結果和修改處理結果如實、完整地記錄下來，由作業組長簽名認可。
  3．階段性檢查制度對建庫的每個階段性成果要進行嚴格檢查把關，如圖件掃描矢量化后的圖素檢查，屬性錄入后的圖元、屬性一致性檢查等。