工區地層屬塔里木-南疆地層大區中天山-馬鬃山地層分區之溫泉地層小區。區域上出露地層有下元古界溫泉群、中元古界長城系哈爾達坂群莫合西薩依組、中元古界薊縣系庫松木切克群、泥盆系中統汗吉尕組、泥盆系上統托斯庫爾它烏組、石炭系下統大哈拉軍山組、石炭系下統章古蘇組、石炭系下統阿恰勒河組、二疊系下統烏朗組和新生界。其中下元古界溫泉群上亞群、中元古界長城系哈爾達坂群莫合西薩依組為該區鉛鋅多金屬的主要含礦層位。

 

  本區大地構造位置位于哈薩克斯坦-準噶爾板塊伊犁地塊及其大陸邊緣之賽里木中間地塊北緣，北以博爾塔拉河斷裂、南以博羅科努-阿其克庫都克斷裂為界分別與阿拉套古生代活動陸緣、博羅霍洛早古生代被動陸緣相鄰。區域內褶皺較發育，主構造線北西西向、近東西向。主要有哈爾達坂向斜和牙馬特南山向斜。

 

  區域內斷裂構造較為發育，形成以近東西向或北西西-南東東向區域性大斷裂為主、次級北西西向斷裂和晚期北東-南西向斷裂為輔的多序次斷裂體系。區域性大斷裂往往是界一級地層的分界斷裂，主要有博爾塔拉河斷裂、牙馬特斷裂和沃托格賽斷裂；次級斷裂與區域性大斷裂夾角大多15°以內，也往往具有控巖作用，其往往是系一級地層的分界斷裂，有時控制著侵入巖的侵位；北東向斷裂形成較晚，對早期形成的斷裂有穿切及錯動。